Universal heeft echter al een vervanger gevonden voor Verbinski: Juan Carlos Fresnadillo, bij ons vooral bekend als schrijver en regisseur van 28 Weeks Later. Verbinski blijft wel aan als producent.
BioShock speelt zich af in een alternatief 1960 en volgt het verhaal van Jack, een man die een vliegtuigcrash heeft overleefd en de dystopische onderwaterstad Rapture moet verkennen. Daarbij moet hij zich weren tegen de aanvallen van de populatie, die bestaat uit gemuteerde wezens en mechanische drones. Tijdens de machtsstrijd komt Jack erachter dat zijn wil toch niet zo vrij is als hij altijd had gedacht. Het scenario is van de hand van John Logan (The Aviator).